正确处理全面深化改革的重大关系是2016年新大纲的替换考点，之前的大纲只有“正确处理改革、发展、稳定的关系”，并且多次考过。今年在此考点中，又增加了两个关系，重要性不言而喻。
1.处理好整体推进和重点突破的关系
全面深化改革是关系党和国家事业发展全局的重大战略部署，是一个涉及经济社会发展各领域的复杂系统工程，任何一个领域的改革都会牵动其他领域，同时也需要其他领域改革密切配合。因此，要坚持整体推进，统筹谋划深化改革各个方面、各个层次、各个要素，注重推动各项改革相互促进、良性互动、协同配合，注重改革措施整体效果。但整体推进又不是平均用力、齐头并进，而是要注重抓主要矛盾和矛盾的主要方面，注重抓重要领域和关键环节。重要领域“牵一发而动全身”，关系到改革大局，是改革的重中之重;关键环节“一子落而满盘活”，关系到改革成效，是改革的有力支点。以这些重要领域和关键环节为突破口，可以对全面改革起牵引和推动作用。
2.处理好顶层设计和摸着石头过河的关系
摸着石头过河就是坚持边实践边总结，积累经验后逐步推开，出现问题就及时应对，发现错误就马上纠正，从实践中获得真知。回顾我国改革开放的历程，摸着石头过河是富有中国特色、符合中国国情的改革方法，也是符合马克思主义认识论和实践论的方法。随着改革向纵深发展，仅仅强调石头过河，已经不能完全适应形势发展的需要，必须加强顶层设计总体规划，提高改革决策的科学性，增强改革措施的协调性。摸着石头过河和顶层设计是辩证统一的，推进局部的阶段性改革开放要在加强顶层设计的前提下进行，加强顶层设计要在推进局部的阶段性改革开放的基础上来谋划。全面深化改革要加强宏观思考和顶层设计，更加注重改革的系统性、整体性，同时也要继续鼓励大胆试验、大胆突破，不断把改革引向深入。
3.处理好改革、发展、稳定的关系
改革、发展、稳定是我国社会主义现代化建设的三个重要支点。江泽民把三者比喻为现代化建设棋盘上的三着紧密关联的战略性棋子，每一着棋都下好了，相互促进，就会全局皆活;如果有一着下不好，其他两着也会陷入困境，就可能全局受挫。目前，改革、发展、稳定三者之间相互交融、相互作用的态势更加明显，稍有不慎，就会影响中国特色社会主义建设大局，因此，必须正确处理好三者之间的关系。改革是经济社会发展的强大动力，发展是解决一切经济社会问题的关键，稳定是改革发展的前提。30多年来，我国社会发生的变革前所未有，同时保持了安定团结。这充分证明，只有社会稳定，改革发展才能不断推进;只有改革发展不断推进，社会稳定才能具有坚实基础。要把改革力度、发展速度和社会可承受程度统一起来，把改善人民生活作为正确处理改革、发展、稳定关系的重要结合点，在保持社会稳定中推进改革和发展，通过改革发展促进社会稳定。
